Converti NBIB in PDF

Un gestore di citazioni, un sistema di invio o un destinatario potrebbe richiedere un PDF stampabile invece di un'esportazione .nbib. La conversione produce una bibliografia formattata; non scarica gli articoli in full text identificati dai record.

Cos'è il formato NBIB

NBIB è un formato bibliografico in testo semplice con tag utilizzato da PubMed e dai relativi servizi della National Library of Medicine. Un record può contenere autori, titoli, dati della rivista, date di pubblicazione, abstract, DOI, ID PubMed e altri campi del catalogo. PubMed crea il file quando si selezionano i record e si sceglie Cite → Download .nbib.

I file NBIB sono comunemente codificati come UTF-8 anziché essere limitati ad ASCII. Sono destinati al trasferimento dei metadati delle citazioni a reference manager come Zotero ed EndNote, non alla memorizzazione di pagine di articoli, figure, layout degli editori o PDF full text incorporati.

Cos'è il formato PDF

PDF è un formato di documento a layout fisso che può mantenere impaginazione, font, margini, tabelle e ritorni a capo tra diversi sistemi operativi. È adatto per stampare, inviare, condividere e archiviare una bibliografia finalizzata, ma è meno pratico di NBIB per correggere i record o applicare uno stile di citazione diverso.

Un PDF generato da NBIB contiene solo le informazioni bibliografiche importate, a meno che non si ottengano e aggiungano separatamente le pubblicazioni citate. Un DOI o un ID PubMed è un link o un identificatore, non il contenuto dell'articolo.

Convertire con Zotero

1. Installare e aprire Zotero, quindi scegliere File → Import.
2. Selezionare l'opzione per importare un file e aprire il file citations.nbib. Zotero dovrebbe identificare i record PubMed e aggiungerli alla libreria.
3. Selezionare gli elementi importati, aprire il menu contestuale e scegliere Create Bibliography from Items.
4. Scegliere lo stile richiesto, ad esempio Vancouver, AMA o APA, quindi copiare la bibliografia formattata o salvarla tramite l'opzione di output disponibile.
5. Incollare il risultato in Microsoft Word, LibreOffice Writer o Google Docs. Impostare il formato della pagina, i margini, il font e la spaziatura, quindi scegliere File → Export → PDF in Word o LibreOffice, oppure File → Download → PDF in Google Docs.

Questo flusso di lavoro è preferibile quando è necessario eliminare i duplicati, modificare gli stili di citazione, correggere la bibliografia o conservare un documento sorgente modificabile prima dell'esportazione.

Convertire con EndNote

1. Aprire EndNote e scegliere File → Import → File.
2. Selezionare il file NBIB. Se EndNote non rileva il formato, scegliere il filtro di importazione PubMed (NLM) o il filtro NLM equivalente disponibile nella propria installazione.
3. Esaminare e selezionare i riferimenti importati, quindi generare una bibliografia formattata utilizzando lo stile di output richiesto. Esportare o aprire il documento risultante in Word o in un altro elaboratore di testi.
4. Utilizzare il comando File → Save As o File → Export dell'elaboratore di testi per creare il PDF.

I nomi dei menu di EndNote variano in base alla versione, quindi il comando esatto per l'output della bibliografia potrebbe essere diverso. I passaggi essenziali sono importare utilizzando il filtro PubMed/NLM, selezionare uno stile di output ed esportare il risultato formattato da un'applicazione per documenti.

Utilizzare PubMed e un browser

Per un numero ridotto di citazioni non è necessario un reference manager locale. In PubMed, selezionare i record, scegliere Cite, selezionare lo stile di citazione richiesto, copiare i riferimenti formattati, incollarli in un documento ed esportare o stampare in PDF. È anche possibile utilizzare il comando Print → Save as PDF del browser dopo aver visualizzato le citazioni formattate.

Questa è l'opzione online più sicura perché i record rimangono in PubMed invece di essere caricati su un servizio di conversione sconosciuto. Offre meno controllo sull'eliminazione dei duplicati, sulla correzione dei campi e sulla gestione della bibliografia rispetto a Zotero o EndNote.

Considerazioni sui converter online

Non esiste uno standard di rendering PDF ampiamente accettato per NBIB e i converter generici per l'upload spesso trattano il file come testo non strutturato, producendo un PDF di tag grezzi invece di una bibliografia formattata correttamente. Non affidarsi a un servizio a meno che non supporti esplicitamente il parsing PubMed/NBIB, mostri lo stile di citazione selezionato e indichi come vengono gestiti i file caricati.

Per riferimenti non pubblicati, metadati relativi a pazienti o record con licenza, utilizzare Zotero, EndNote, PubMed o un'applicazione per l'ufficio locale invece di caricare il file. Aprire NBIB in Notepad e stamparlo in PDF è tecnicamente possibile, ma il risultato normalmente contiene tag come AU, TI e DP, non citazioni pronte per la lettura.

Controlli di qualità e compatibilità

• Verificare l'ordine degli autori, i nomi, le abbreviazioni delle riviste, le date, i numeri di volume e fascicolo, gli intervalli di pagine, i valori DOI e i caratteri non ASCII. I metadati PubMed possono essere incompleti o incoerenti.
• Utilizzare lo stile di citazione richiesto dalla rivista, dall'istituzione o dal destinatario. Vancouver e AMA sono comuni nelle pubblicazioni mediche; APA è comune in molte scienze sociali.
• Rimuovere i record duplicati prima di creare la bibliografia. Esportazioni PubMed ripetute possono importare la stessa citazione più di una volta.
• Se il PDF deve contenere gli articoli effettivi, ottenere il full text legalmente disponibile da PubMed Central, dall'editore o da un abbonamento istituzionale, quindi allegare o unire separatamente quei PDF.
• Conservare il file originale .nbib e la libreria del reference manager. Consentono correzioni, eliminazione dei duplicati e riformattazione successive che un PDF finalizzato non permette.