Converti CDX in PNG

Le strutture ChemDraw vengono esportate in PNG quando un sistema per manoscritti, una presentazione, una pagina web o un editor di immagini richiede un’immagine standard invece di un documento .cdx modificabile. PNG fornisce inoltre un rendering fisso per condividere diagrammi chimici con destinatari che non utilizzano ChemDraw.

Contenuto dei file CDX

CDX è un’estensione di file ambigua. Indica più comunemente il formato nativo binario di ChemDraw e ChemOffice, utilizzato per strutture chimiche, reazioni, annotazioni, etichette degli atomi, stereochimica e layout di pagina modificabile. Conservare questo file sorgente perché mantiene gli oggetti chimici e le informazioni di disegno che PNG non può preservare.

Anche un formato legacy di disegno compresso di CorelDRAW ha utilizzato .cdx. I file CDX di ChemDraw e quelli di CorelDRAW non sono intercambiabili; identificare quindi l’applicazione che ha creato il file prima di selezionare il software o un servizio online.

Perché si utilizza PNG

PNG è un formato raster senza perdita supportato da browser, software per l’ufficio, sistemi di pubblicazione ed editor di immagini. Supporta la trasparenza e conserva più accuratamente le linee sottili dei legami, i cunei, i pedici e il testo rispetto a JPEG, la cui compressione con perdita può introdurre artefatti visibili intorno agli elementi grafici lineari.

PNG contiene pixel anziché strutture chimiche modificabili. Non conserva la connettività molecolare, i dati della struttura ricercabili, i metadati della reazione o le etichette modificabili.

Esportazione dei file CDX di ChemDraw

1. Aprire il file in ChemDraw utilizzando File → Open.
2. Controllare il layout finale previsto prima dell’esportazione. Correggere le etichette degli atomi tagliate, gli oggetti sovrapposti, i limiti della pagina e lo spessore delle linee dei legami alle dimensioni di visualizzazione finali.
3. Utilizzare File → Export e selezionare PNG. La dicitura esatta dei menu e le opzioni di esportazione disponibili variano a seconda della versione di ChemDraw.
4. Impostare le dimensioni in pixel richieste. Per la stampa a una larghezza fisica nota, calcolare i pixel moltiplicando la larghezza in pollici per il valore di ppi richiesto; 85 mm a 300 ppi corrispondono a circa 1.000 pixel di larghezza, mentre 170 mm corrispondono a circa 2.000 pixel.
5. Selezionare uno sfondo trasparente solo quando l’applicazione ricevente lo supporta e ne ha bisogno; utilizzare il bianco per un aspetto prevedibile nei programmi di videoscrittura e nei flussi di lavoro di stampa.
6. Aprire il PNG esportato alle dimensioni del 100% e controllare le etichette degli atomi, le cariche, i cunei stereochimici, le frecce e il testo di piccole dimensioni.

Utilizzare 300 ppi come valore comune di riferimento per la produzione di stampa quando lo specifica l’editore, ma sono le dimensioni in pixel a determinare i dettagli raster; il valore ppi memorizzato in un PNG influisce principalmente sulle sue dimensioni fisiche predefinite nel software di impaginazione. Non ingrandire un PNG di piccole dimensioni dopo l’esportazione.

Altre opzioni di conversione

Per l’automazione, Open Babel può leggere molti file CDX di ChemDraw e scrivere una rappresentazione PNG quando la build installata include il supporto all’output PNG/Cairo:

obabel input.cdx -O output.png --gen2d

--gen2d genera coordinate bidimensionali quando necessario. Open Babel potrebbe non riprodurre esattamente i font specifici di ChemDraw, il layout di pagina, le frecce delle reazioni o le annotazioni complesse; utilizzare quindi ChemDraw per gli elementi grafici destinati alla pubblicazione e confrontare l’output con l’originale.

CloudConvert e Zamzar offrono la conversione CDX-to-PNG tramite browser, ma verificare che il servizio identifichi il file caricato come file ChemDraw CDX anziché come formato CorelDRAW. Caricare solo file non riservati; i servizi di conversione pubblici non sono adatti a strutture non pubblicate, dati soggetti a normative o materiale dei clienti, a meno che le condizioni relative a privacy e conservazione dei dati non soddisfino i requisiti della policy applicabile.

Per un file CDX legacy di CorelDRAW, aprirlo con la versione compatibile di CorelDRAW o con un importer legacy verificato, quindi utilizzare File → Export per selezionare PNG e impostare le dimensioni in pixel. In genere gli editor di immagini non aprono direttamente nessuna delle due varianti CDX.

Limiti di compatibilità e qualità

PNG non può essere ripristinato in un file CDX modificabile chimicamente senza ridisegnarlo o utilizzare il riconoscimento della struttura chimica. Gli strumenti di riconoscimento possono interpretare in modo errato le etichette degli atomi, le cariche, gli ordini dei legami e la stereochimica.

Conservare il file originale .cdx ed esportare anche un file vettoriale PDF, SVG o EPS quando l’editore o il flusso di lavoro di stampa accetta elementi grafici vettoriali. Un’esportazione vettoriale può essere ridimensionata senza rasterizzare le linee dei legami e il testo, mentre PNG è appropriato quando è richiesta una bitmap fissa.